7世紀後半、国司がおかれた際に天武天皇（在位673～86）が勅願道場として建立したのがはじまり。本尊は薬師瑠璃光如来を主尊とする七仏の薬師如来座像で、弘仁6年（815）には弘法大師がこれらの尊像を拝むために訪れている。弘法大師が四国修行の途中、錫杖を突き立てると水が湧き出たことから「井戸寺」と称する（伝）。境内にある大師ゆかりの「面影の井戸」は、のぞきこんで姿が映れば無病息災だといわれている。

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